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教你一招:如何从一份土壤样本中同时提取微生物RNA和DNA
作者:   发表时间:2019-09-03


环境微生物组最常见的样本类型就是土壤,但土壤样本种类繁多、组分也相对复杂,并且微生物细胞紧紧吸附在土壤颗粒表面且有大量的抑制剂存在,使得从土壤样本中获取无偏好、高质量的微生物总DNA或RNA具有很大难度。



(一)为什么土壤样本微生物核酸很难提取的比较好呢?

1

微生物裂解不充分,核酸不能够充分释放,也会影响微生物多样性的评估

2

土壤种含有的很多抑制剂:腐殖质(腐植酸,黄腐酸等腐殖质)含量高,去除不好会严重影响下游PCR,文库构建等一系列下游实验。



(二)QIAGEN如何做到土壤样本微生物充分裂解和抑制剂彻底去除呢?


新一代珠磨研磨管——微生物高效裂解法宝

如何高效裂解土壤中的微生物细胞是万里长征的第一步,否则不能保证微生物多样性。这个裂解管有三大作用:帮助分散土壤颗粒;有效提高微生物和裂解珠碰撞几率;高效裂解革兰氏阳性菌。

比如:

 

A. 1.8ml白念珠菌分别用DNeasy PowerSoil Kit及DNeasy PowerSoil Pro Kit提取结果比较。

B、250mg堆肥、粘土、表层土壤样本分别用DNeasy PowerSoil Kit及DNeasy PowerSoil Pro Kit提取结果比较。


第二代IRT技术——腐植酸

困扰土壤样本DNA提取的最大问题是其中的腐殖质(腐植酸,黄腐酸等腐殖质)含量高。腐植酸由有机物降解形成,并使得土壤呈现黑颜色(苯醌基的分子结构)。腐植酸分子都含有羧基和酚基,分子量大小不一,它们与核酸一样都是大分子亲水性阴离子聚合物,很容易在最后步骤和核酸一起被抽提出来。

QIAGEN的一种创新的专_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x0008_利方法,我们称之为第二代抑制剂去除技术(IRT),专_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x0008_为高腐植酸含量的环境样品所设计,难以处理的土壤样本类型等如堆肥,沉积物和肥料等。经升级版的IRT技术处理后的DNA可获得A260/280比值接近1.8的保证,核酸A260/230比值也是同类产品中最高的。

比如:

 

市面上常见各款试剂盒抽提250mg土壤样本DNA质量比较。

A. DNeasy PowerSoil Pro Kit A260/280比值最接近1.8  

B. DNeasy PowerSoil Pro Kit A260/230比值最高


MB硅胶膜离心柱——高品质DNA又一保证

众所周知的QIAGEN硅胶膜品质,我们无需赘述了。在这一款全新土壤微生物DNA纯化试剂中,可以说QIAGEN将结合、洗涤、洗脱的buffer和专_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x0008_用微生物核酸硅胶膜离心柱MB Spin Column的使用配合达到了最优化配置。


 QIAGEN在微生物组研究领域的领导地位

作为样本制备,二代测序和数据分析研究解决方案的行业先驱,QIAGEN是全球微生物组研究计划的知名支持者。国际微生物组项目如人类微生物组计划(HMP),地球微生物组计划(EMP)和地铁微生物组联盟计划(Meta SUB)都正在使用及推荐QIAGEN的微生物组产品。



(三)为什么QIANGEN可以同时从土壤样本中同时提取RNA和DNA?

同一份土壤样本,按照操作步骤先把RNA洗脱下来,再利用一个DNA洗脱柱就可以完美的分离一份土壤样本中的RNA和DNA。

 



这么好的产品一定要搞点事情


为了让大家可以更好的体验土壤RNA+DNA产品线的组合效果,从即日起QIAGEN正式推出“土壤RNA+DNA同时提取专_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x0008_享促销方案”,广东地区用户可享受以下产品62折优惠,让您在今夏能够更好的亲自去体验最佳土壤RNA+DNA分离方法。

活动持续到2019年10月22日,赶快抓紧时间订购吧!



产品信息/参数


产品 货号 促销价(两个货号同时购买即可享受超值优惠价
RNeasy PowerSoil Total RNA Kit 12866-25 3274元
RNeasy PowerSoil DNA Elution Kit 12867-25


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